一、检修方便。检修沼气池时，在池内充分通风、换气的条件下，既可以从顶部密封口进入沼气池，又可以从底层出料口进入沼气池。
二、出料方便。由于底层出料沼气池的出料口位于池底，出料间的料液深度大，方便非机械大量出料，甚至可以出尽全池的料液;而中层出料沼气池在出料间内只能清出高于出料间底部的料液，要出更多的料液必须打开密封盖方可。
三、清池方便。由于底层出料池的池底向出料口有一定的坡度，在清池时用水冲刷池底时，池底污泥、沉渣即向出料口流动进入出料间，仅清理出料间即可将池底污泥、沉渣清理干净，而不必象中层出料沼气池必须进池挖料。

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